総トン数２０トン以上の船舶について、運航に供するためには、船籍港を管轄する法務局に所有権保存登記を行い、その船籍港を管轄する官海官庁（地方運輸局等）に登録の手続きが必要です。
| 項目 | 料金（税別、1件あたり、円） |
| 船舶所有権保存登記 | 50,000円～ |
| 船舶所有権移転登記 | 50,000円～ |
| 抵当権・賃借権設定登記 | 40,000円～ |
| 上記関連業務 | 1時間10,000円 |
| 船舶新規登録 | 100,000円～ |
| 船舶変更、訂正登録 | 80,000円～ |
| 船舶抹消登録 | 40,000円～ |
| 船舶国籍証書交付・再交付・書換 | 80,000円～ |
